對(duì)方代墊的運(yùn)費(fèi)應(yīng)該計(jì)入“應(yīng)付賬款”科目。具體操作如下：
1. 在收到對(duì)方代墊運(yùn)費(fèi)的發(fā)票時(shí)，應(yīng)該先確認(rèn)運(yùn)費(fèi)的金額和對(duì)方的付款方式。
2. 然后，將該筆應(yīng)付賬款記入“應(yīng)付賬款”科目中。記賬時(shí)，應(yīng)該按照對(duì)方的付款方式來(lái)決定使用哪個(gè)科目進(jìn)行記賬。
3. 如果對(duì)方使用現(xiàn)金或支票支付，應(yīng)該在“銀行存款”科目中記一筆相應(yīng)的收款，以反映實(shí)際的收入情況。
4. 如果對(duì)方使用銀行轉(zhuǎn)賬支付，應(yīng)該在“銀行存款”科目中記一筆相應(yīng)的收款，同時(shí)在“銀行對(duì)賬單”中查看該筆轉(zhuǎn)賬是否已經(jīng)到賬，以確認(rèn)收入情況。

總之，對(duì)方代墊的運(yùn)費(fèi)應(yīng)該記入“應(yīng)付賬款”科目，同時(shí)需要根據(jù)對(duì)方的付款方式來(lái)決定是否需要在其他科目中進(jìn)行相應(yīng)的記賬。