工程利潤率和毛利率都是衡量企業(yè)盈利能力的指標，但它們的計算方式和意義有所不同。

工程利潤率是指企業(yè)在完成某項工程項目后所獲得的凈利潤與該工程項目的總成本之比。通常用于評估企業(yè)在工程項目中的盈利能力，可以反映企業(yè)的工程管理水平和成本控制能力。

毛利率是指企業(yè)銷售產品或提供服務后所獲得的毛利潤與銷售收入之比。毛利率是評估企業(yè)經(jīng)營能力的重要指標之一，可以反映企業(yè)的產品或服務質量、市場競爭力和成本控制能力。

因此，工程利潤率和毛利率的區(qū)別在于，前者是針對工程項目的盈利能力進行評估，后者是針對整個企業(yè)的經(jīng)營能力進行評估。