在兩個(gè)公司同時(shí)申報(bào)工資且5000元減稅費(fèi)用重復(fù)了，通常有以下處理方式： 日常申報(bào)調(diào)整 如果還處于納稅申報(bào)的當(dāng)期，可以由其中一家公司在申報(bào)時(shí)進(jìn)行調(diào)整。在自然人電子稅務(wù)局扣繳端的“人員信息采集”中，找到該員工信息，將“是否扣除減除費(fèi)用”欄次選擇“否”，這樣就能避免重復(fù)扣除。 年度匯算清繳 - 自行申報(bào)：在次年3月1日至6月30日期間，通過(guò)個(gè)人所得稅App或自然人電子稅務(wù)局網(wǎng)頁(yè)端進(jìn)行年度匯算清繳。在匯算清繳申報(bào)時(shí)，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)將兩處的工資收入合并計(jì)算，扣除全年6萬(wàn)元以及專(zhuān)項(xiàng)扣除、專(zhuān)項(xiàng)附加扣除等后，按照綜合所得稅率表計(jì)算應(yīng)納稅額，多退少補(bǔ)。