那后面開票了怎么申報？

補開票。沖減未開票收入后的金額申報

免稅銷售額那里填寫，比如我做未開票收入20萬，免稅金額就是20萬，本季度申報；然后下個季度開票了20萬，那我就是0申報嘛？

是的，你的理解是對的。