老師 他說10月入職某公司 每月工資均為20000 應該是20000*3吧

是的，你說的對，是我題目看錯了，那三險一金也要改成2500*3 小李全年應納個稅=【20000*3+（3000+30000）*（1-20%）+30000*（1-20%）*70%+3000*（1-20%）-60000-2500*3-1000*12】*適用稅率-速算扣除數(shù)

那他那個每月減除費用5000 是用入職的三個月來計算還是用全年12個月來計算

減除費用按60000。 根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于辦理2020年度個人所得稅綜合所得匯算清繳事項的公告》 應退或應補稅額=[（綜合所得收入額-60000元-“三險一金”等專項扣除-子女教育等專項附加扣除-依法確定的其他扣除-捐贈）×適用稅率-速算扣除數(shù)]-2020年已預繳稅額