企業(yè)應該在發(fā)現社保賬戶余額不足的情況下，及時補繳員工的社保。企業(yè)可以向當地的社保部門申請補繳，補繳的方式有以下幾種： 1、現金：直接向社保部門存入相應的補繳金額，并附上補繳單據； 2、轉賬：可以向社保部門開具轉賬指令，將補繳金額轉入社保賬戶； 3、票據：可以向銀行開具票據，將補繳金額轉入社保賬戶； 4、支票：可以向社保部門開具支票，將補繳金額轉入其社保賬戶； 5、網上支付：可以通過社保部門統(tǒng)一的網上支付系統(tǒng)，將補繳金額轉入社保賬戶； 補繳完成后，企業(yè)應及時將補繳的收據交給社保部門，并完成補繳手續(xù)。 此外，社會保險扣費是按照當地社保部門的規(guī)定執(zhí)行的，所以在繳納社保時，企業(yè)也要注意社保政策的相關規(guī)定，確保補繳滿足當地社保部門相關要求。