首先，某單位應(yīng)該將借款賬戶中的300萬元轉(zhuǎn)入銀行存款賬戶。然后，應(yīng)對工程款500萬元進(jìn)行記賬，將支付賬款300萬元借方記賬，銀行存款貸方記賬。最后，某單位應(yīng)在下一次支付中將預(yù)付賬款300萬元從借款賬戶轉(zhuǎn)入工程款500萬元的貸款賬戶，以便將借款歸還。