是的，如果對方打款附言是保證金，那么可以在往來款中入賬。在企業(yè)會計系統(tǒng)中，保證金是指一種為了確保企業(yè)按照合同約定完成承諾而收取的一種款項，屬于企業(yè)資金的一種形式，可以采取抵扣的或者另外結(jié)算的形式處理，資金的歸集可以在往來款中入賬，把這筆資金入往來款，但是要在往來款中標(biāo)明“保證金，結(jié)算”的說明，以便于在進(jìn)行報表的時候能夠清楚地分辨出來。 另外，在入賬保證金時，要結(jié)合具體約定及業(yè)務(wù)邏輯進(jìn)行記賬，具體分類歸屬應(yīng)該如何處理要結(jié)合約定的內(nèi)容而定，歸屬銷售收入類還是關(guān)聯(lián)類、費用類、貸方往來款類等，要根據(jù)保證金的來源及用途進(jìn)行分析判斷。