沒有庫存，申請留底退稅時，首先要查詢企業(yè)是否有資格申請留底退稅，如果有資格，則根據(jù)國家稅務(wù)部門的規(guī)定，應(yīng)當(dāng)在實際發(fā)生的留底退稅金額，減去累計轉(zhuǎn)出的部分，申請留底退稅。具體而言，一般應(yīng)當(dāng)填寫申請留底退稅的表格，并附上企業(yè)價稅合計金額、增值稅實際繳納金額以及稅務(wù)機關(guān)出具的累計留底稅款轉(zhuǎn)出憑證等相關(guān)資料，向稅務(wù)機關(guān)提交申請，由稅務(wù)機關(guān)審核通過后，辦理留底退稅手續(xù)。 此外，企業(yè)在申請留底退稅時，應(yīng)注意提交的資料合法且完整，及時準(zhǔn)確的向稅務(wù)機關(guān)繳納稅款，遵守稅政政策，并嚴(yán)格按照政府規(guī)定執(zhí)行政策，從而有效地控制申請留底退稅的風(fēng)險。