根據(jù)《流轉(zhuǎn)稅暫行條例》的有關(guān)規(guī)定，在征收土地使用權(quán)的情況下，被征收土地使用權(quán)的單位和個人收到的土地使用權(quán)補(bǔ)償金和貨幣補(bǔ)償金均應(yīng)納稅。 按照年補(bǔ)償租金替代廠房，就是拆遷補(bǔ)償，工程拆遷補(bǔ)償根據(jù)國家規(guī)定應(yīng)納稅，所以該部分補(bǔ)償金也應(yīng)該繳納流轉(zhuǎn)稅。 流轉(zhuǎn)稅是一種使用稅，它的繳納對象是企業(yè)、個體工商戶或者其他組織，收稅的部分涉及土地使用權(quán)價款和收回使用權(quán)土地上的費(fèi)用，收回的稅款除了由稅務(wù)機(jī)關(guān)征收，也可以由政府指定的第三方機(jī)構(gòu)征收。繳納流轉(zhuǎn)稅尚有以下平臺：一是國稅；二是地稅；三是稅務(wù)機(jī)關(guān)代收代繳；四是企業(yè)自行申報(bào)、繳款和網(wǎng)上繳款等等。 因此，在上述情況下，公司名下的廠房被經(jīng)開發(fā)商征收，并按年補(bǔ)償租金的情況下，這部分租金補(bǔ)償應(yīng)該繳納流轉(zhuǎn)稅，否則可能受到有關(guān)稅務(wù)部門的處罰。