是的，獨(dú)立核算的分公司和總公司都是關(guān)聯(lián)企業(yè)，需要填報(bào)年度所得稅匯算。根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第31條的規(guī)定，不同的關(guān)聯(lián)企業(yè)應(yīng)當(dāng)分別適用獨(dú)立核算制度，并且在全年內(nèi)通過財(cái)務(wù)報(bào)表，對母公司和子公司進(jìn)行年度匯算。這樣，在核算完全年應(yīng)納稅所得額等基本數(shù)據(jù)后，就可以進(jìn)行稅費(fèi)匯算了。拓展知識：企業(yè)所得稅匯算是指在關(guān)聯(lián)企業(yè)之間，根據(jù)“分別核算原則”，將企業(yè)所得稅由母公司為子公司代扣代繳，由子公司向母公司進(jìn)行企業(yè)所得稅結(jié)轉(zhuǎn)抵減的清算制度。