農業(yè)合作社的個人所得稅申報一般采用用自然人扣繳端報的方式。由于農業(yè)合作社的主要業(yè)務是經營自有財產，所以在計算個人所得稅時，應當優(yōu)先采用用自然人扣繳端報的方式。通過改善農業(yè)合作社的財務處理效率，提高收入，減少稅收，確保實現(xiàn)集體經濟可持續(xù)發(fā)展。 拓展知識：為了更好地提高稅收，促進農業(yè)合作社的發(fā)展，農業(yè)合作社可以通過改善財務管理系統(tǒng)，更好地控制成本，減少投資成本，給社員提供更優(yōu)厚的福利，使農業(yè)合作社的活動更加穩(wěn)健安全。 應用案例：某農業(yè)合作社本著為農民謀福利、提高收入，改善財務管理系統(tǒng)，建立一套全面合理的完善的財務報表匯總分析和分析判斷體系，從而提高會計算按個人所得稅申報效率，并降低了個人所得稅繳納成本。