民辦非企業(yè)在起初余額有本年利潤科目的余額時，應將其余額進行調整，確保財務報表的準確性和合規(guī)性。根據(jù)相關規(guī)定，民辦非企業(yè)的會計核算應遵循《民間非營利組織會計制度》。 在該制度下，起初余額中的“本年利潤”科目余額應轉入“非限定性凈資產”科目。這是因為“非限定性凈資產”是民間非營利組織報告期內凈資產總額，它代表了民間非營利組織的資產總額在減除了所有負債后的凈資產，而這些凈資產中，有些可能是受到了捐贈者對于資金使用的某些限制，有些則沒有。而“本年利潤”科目在期末應無余額，因為其余額已全部轉入“非限定性凈資產”科目。 因此，對于起初余額中的“本年利潤”科目余額，應將其調整至“非限定性凈資產”科目，以確保財務報表的準確性和合規(guī)性。