那如果我開票是9%，分包單位開給我是3%，預(yù)交增值稅的時(shí)候金額是我開票金額直接減去分包金額嗎？

不是直接減去，而是要根據(jù)稅法規(guī)定計(jì)算。你開9%的票，分包是3%，實(shí)際稅負(fù)不同。預(yù)交時(shí)，通常按你開票的稅率計(jì)算，但具體減免需依據(jù)合同、稅法細(xì)則以及稅務(wù)機(jī)關(guān)規(guī)定操作。建議詳細(xì)核對(duì)稅法或咨詢專業(yè)人士。