可以扣除。這個大額醫(yī)療費用如果是由公司統(tǒng)一扣繳并作為社保補充的一部分，通?？梢栽趥€人所得稅申報時按相關(guān)政策規(guī)定進行扣除。具體扣除標準和方式建議參照當?shù)囟悇站值囊?guī)定或指南。