在公司破產(chǎn)情況下，未勾選的進項發(fā)票通常會失去抵扣稅款的機會，因為稅務(wù)局通常要求企業(yè)正常運營時進行勾選。至于原材料和庫存商品，它們將由破產(chǎn)管理人處理，可能用于償還債務(wù)或通過拍賣等方式變現(xiàn)。具體操作需要遵循破產(chǎn)法律程序和破產(chǎn)管理人的安排。