老師好：我是一家房地產企業(yè)，有一項目需配建經濟適用房，公司對項目的規(guī)劃和定位，沒有在項目中配建經濟適用房，經與相關部門協(xié)商，同意我單位在其它房產公司購買了經濟適用房，并給我單位開具發(fā)不動產的專票?，F(xiàn)在把這些經濟適用房給相關部門時，相關部門認為我們這應該算是二手房，不同意按移移交處理，讓開具發(fā)票，但又不給錢。這個該如何處理？我購買經濟適用房產生的支出怎樣處理？