扣掉的這部分是員工工資還是什么

主要是，你沒說是什么經營項目呀？如果建筑，那扣的就是分包。

人力資源呢 老師

那可以扣的是工資、社保了。

開差額票對方是不可以抵扣進項嗎

差額部分只能開普票，對方不能抵扣。