《國家稅務總局關于調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知》（國稅函[2009]617號）第一條規(guī)定：“增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應在開具之日起180日內(nèi)到稅務機關辦理認證，并在認證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。”第二條規(guī)定：“實行海關進口增值稅專用繳款書（以下簡稱海關繳款書）”先比對后抵扣“管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日內(nèi)向主管稅務機關報送《海關完稅憑證抵扣清單》（包括紙質資料和電子數(shù)據(jù)）申請稽核比對。未實行海關繳款書”先比對后抵扣“管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日后的第一個納稅申報期結束以前，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。”

　　基于以上規(guī)定，納稅人取得的增值稅發(fā)票必須在開具后的180天之內(nèi)進行認證并申報抵扣，可是，在實踐當中，總是存在各種客觀原因，即不是納稅人可以可控制的各種客觀原因，導致取得的增值稅發(fā)票超過開具后的180天，能否進行抵扣一直是廣大企業(yè)所關心的問題，如何解決這個問題，國家稅務總局下發(fā)《關于廢止逾期增值稅扣稅憑證一律不得抵扣規(guī)定的公告》（國家稅務總局公告2011年第49號）和《關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國家稅務總局公告2011年第50號），對《國務院辦公廳轉發(fā)國家稅務總局關于全面推廣應用增值稅防偽稅控系統(tǒng)意見的通知》（國辦發(fā)[2000]12號）第三條中“凡逾期未申報認證的，一律不得作為扣稅憑證”的規(guī)定進行了否定。即從2011年10月1日起， 根據(jù)《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》和《關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國家稅務總局公告2011年第50號）的規(guī)定，增值稅一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，可向主管稅務機關申請辦理逾期抵扣進項稅額，具體的稅務處理如下：

　?。ㄒ唬┯馄诘挚蹜{證范圍必須是2007年1月1日以后開具的增值稅扣稅憑證，包括增值稅專用發(fā)票、海關進口增值稅專用繳款書和公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票。

　　（二）逾期抵扣適用情形增值稅一般納稅人必須發(fā)生真實交易，且由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的才能申報抵扣，否則還是不能抵扣。逾期可抵扣情形如下：

　　1.因自然災害、社會突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期；

　　2.增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導致逾期；

　　3.有關司法、行政機關在辦理業(yè)務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務，或者稅務機關信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡故障，未能及時處理納稅人網(wǎng)上認證數(shù)據(jù)等導致增值稅扣稅憑證逾期；

　　4.買賣雙方因經(jīng)濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期；

　　5.由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導致增值稅扣稅憑證逾期；

　　6.國家稅務總局規(guī)定的其他情形。

　?。ㄈ┯馄诘挚蹖徟绦蛴馄谇曳峡陀^原因的扣稅憑證，必須經(jīng)主管稅務機關審核、逐級上報，再由國家稅務總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，才能繼續(xù)抵扣其進項稅額。

　?。ㄋ模┮话慵{稅人在逾期抵扣審批過程中需要提供的相關資料

　　1、《逾期增值稅扣稅憑證抵扣申請單》；

　　2、增值稅扣稅憑證逾期情況說明。納稅人應詳細說明未能按期辦理認證或者申請稽核比對的原因，并加蓋企業(yè)公章。其中，對客觀原因不涉及第三方的，納稅人應說明的情況具體為：發(fā)生自然災害、社會突發(fā)事件等不可抗力原因的，納稅人應詳細說明自然災害或者社會突發(fā)事件發(fā)生的時間、影響地區(qū)、對納稅人生產(chǎn)經(jīng)營的實際影響等；納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期的，納稅人應詳細說明辦理搬遷時間、注銷舊戶和注冊新戶的時間、搬出及搬入地點等；企業(yè)辦稅人員擅自離職，未辦理交接手續(xù)的，納稅人應詳細說明事情經(jīng)過、辦稅人員姓名、離職時間等，并提供解除勞動關系合同及企業(yè)內(nèi)部相關處理決定。

　　3、客觀原因涉及第三方的，應提供第三方證明或說明。具體為：企業(yè)辦稅人員傷亡或者突發(fā)危重疾病的，應提供公安機關、交通管理部門或者醫(yī)院證明；有關司法、行政機關在辦理業(yè)務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，導致納稅人不能正常履行申報義務的，應提供相關司法、行政機關證明；增值稅扣稅憑證被盜、搶的，應提供公安機關證明；買賣雙方因經(jīng)濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證的，應提供賣方出具的情況說明；郵寄丟失或者誤遞導致增值稅扣稅憑證逾期的，應提供郵政單位出具的說明。

　　由于稅務機關自身原因造成納稅人增值稅扣稅憑證逾期的，主管稅務機關應在上報文件中說明相關情況。具體為，稅務機關信息系統(tǒng)或者網(wǎng)絡故障，未能及時處理納稅人網(wǎng)上認證數(shù)據(jù)的，主管稅務機關應詳細說明信息系統(tǒng)或網(wǎng)絡故障出現(xiàn)、持續(xù)的時間，故障原因及表現(xiàn)等。

　　4、逾期增值稅扣稅憑證電子信息；

　　5、逾期增值稅扣稅憑證復印件（復印件必須整潔、清晰，在憑證備注欄注明“與原件一致”并加蓋企業(yè)公章，增值稅專用發(fā)票復印件必須裁剪成與原票大小一致）。