非盈利性醫(yī)療機構享受營業(yè)稅的稅收優(yōu)惠。應將盈利性的收入和非盈利性的收入分開核算。印花稅除了規(guī)定免征的項目外，其他的應稅合同都要繳納。個人所得稅是代扣繳，不是你單位繳納的。非盈利性醫(yī)療機構自用的房產(chǎn)按規(guī)定是可以免征房產(chǎn)稅，但若將房產(chǎn)作為出租經(jīng)營，則租金收入應按規(guī)定繳納營業(yè)稅、房產(chǎn)稅等。