是的，自然人個人申報扣繳端本期收入應該將單位承擔的社保部分金額加在申報金額里面。因為社保費用是企業(yè)（或單位）承擔，并將由企業(yè)（或單位）為員工代扣代繳，在個稅計算中，要將單位承擔的社保部分金額加在申報金額里，要扣除的個人所得稅也會隨著社保的加入而增加，這樣會避免企業(yè)為員工代扣的社保部分不被抵扣的情況出現。同時，這也可以避免造成個人所得稅的不透明，從而可以減少未來查賬時可能出現的重復繳稅問題。 拓展知識：增值稅和所得稅是中國政府實施的主要稅種，分別對應企業(yè)稅費和個人所得稅。不同稅種有著不同的稅負，比如增值稅是按照服務或者商品銷售的實際價格支付的，而個人所得稅是按照個人的收入和支出計算的。