是的，可以抵扣500。根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理條例》第三條規(guī)定：對于符合有關(guān)憑證稅務(wù)登記等規(guī)定，經(jīng)稅務(wù)機關(guān)核定發(fā)票金額真實、有效，可以合法使用的增值稅專用發(fā)票，納稅人可根據(jù)其可抵扣項目的金額，采取分次抵扣或者一次性抵扣的方式。因此，你在具體的抵扣情況中，可以采取分次抵扣的方式，只抵扣1000元中的500元，剩下的500元也可以抵扣，但一定要按照規(guī)定的抵扣流程來進(jìn)行，以免造成政策違規(guī)。