個體工商戶開票的個稅稅率為3%。根據《中華人民共和國個人所得稅法》，個人所得稅的稅率分為四類：3%、10%、20%和25%。3%的稅率適用于收入不超過4000元的個人；10%的稅率適用于收入在4000元至80000元之間的個人；20%的稅率適用于收入在80000元至200000元之間的個人；25%的稅率適用于收入超過200000元的個人。