是的，農(nóng)業(yè)企業(yè)出租自有的蔬菜大棚需要交印花稅。根據(jù)《印花稅暫行條例》的規(guī)定，財產(chǎn)租賃合同包括租賃房屋、船舶、飛機、機動車輛、機械、器具、設備等，都需要繳納印花稅。因此，農(nóng)業(yè)企業(yè)出租自有的蔬菜大棚需要按照財產(chǎn)租賃合同繳納印花稅